Alles begann im Jahr 1962, als Hans-Georg und Lore Padeffke den Betrieb als Bäckerei-Konditorei Padeffke in Laichingen auf der schwäbischen Alb gründeten. 1969 erbaute Hans-Georg Padeffke im neuen Siedlungsgebiet Mössingen-Bästenhardt die erste eigene Backstube samt Verkauf. Die erste Padeffke-Filiale wurde 1987 in Ofterdingen nahe Mössingen eröffnet, welche bis heute noch Bestand hat. In den 90er Jahren wurde dann die Einzelfirma in eine GmbH umgewandelt und die Geschäftsführung an die aktuellen Geschäftsführer Michael und Petra Padeffke übergeben.

Seit 1997 befinden sich Backstube und Verwaltung im Mössinger Gewerbegebiet „Schlattwiesen“. Heute ist die Bäckerei Padeffke, ein Handwerksunternehmen mit 300 Mitarbeitern – dazu zählen 40 Bäcker und Konditoren, 200 Fachverkäuferinnen und die Teams in Verwaltung, Versand und Reinigung sowie derzeit 15 Auszubildende.